康妈妈科技农业园做为一个政府补贴和企业投资混业经营管理的盈利性机构，具有市场经济条件下的完全企业属性，自主经营、自负盈亏。其商业模式和盈利模式是在厦门作为长江以南的“总部经济”的概念和营运中心，向28家台湾农民创业园和农业科技区实现横向合作，将品牌和经营管理模式的核心竞争力发挥到极致。
有生产、加工、销售等多环节的全产业链模式的营运来实现健康盈利空间。实现渠道共享、品牌共享和技术共享的融合型发展模式，充分实现共享、共建、共发展的内循环和外循环的国家战略相结合，国际国内双循环的发展格局的注入有形活力。
管委会作为科技农业园的管理机构，主要工作目标和任务一是依托厦门食品产业和农产品产业转型升级的重要时段，康妈妈科技农业产业园加大针对涉农台商的招商工作，整合福建的涉农台商的整体资源，发展壮大产业园；其次是把国家出台的农林22条惠台涉农企业的政策充分实施和贯彻好，加大两岸农业融合发展的力度，实现十四五期间福建省关于两岸融合发展的战略目标；三是进一步提升台商在食品行业的竞争能力，在农产品加工方面加大创新领先的投资力度，引进和创新并驾齐驱；四是在农产品生产、加工领域的技术研发方面加大投资力度，积极和国内外的科研院所加大合作力度，特别是在人才引进和培养方面着力实施高端人才引进的力度，建立院士工作站和博士后工作站的工作。